著有《植物名实图考》38卷。计引植物1714种，不仅是记述植物药品的巨著，对现代采集药物和植物分类的鉴定工作亦大有帮助。其科学价值，一是纠正了一些本草学家的错误；二是附图特别精确；三是很多植物后来中名定名以其为依据。还编著有《植物名实图考长编》22卷（收录植物838种）、《云南矿产工器图略》、《滇南矿厂舆程图》、《滇行纪程集》、《军政辑要录》、《奏议存汇》、《治淮上游论》、《念余阁诗钞》及《弹谱》等。